Colossal Biosciences lanza una plataforma de IA para la desextinción

Colossal Biosciences anunció el miércoles una nueva plataforma de IA, llamada GenoMorph, creada para acelerar su trabajo de desextinción al identificar qué genes editar cuando solo sobrevive información genética limitada de una especie extinta. La empresa la está aplicando primero a su esfuerzo por revivir al dodo, para el cual cuenta con un solo genoma utilizable, frente a los 100 genomas que ha reunido para su proyecto del mamut lanudo, ya que el ADN se degrada más rápido en los climas tropicales donde vivía el dodo que en las regiones frías que preservaron los restos del mamut.

Lamm explicó que normalmente los científicos comparan muchos genomas para identificar qué diferencias genéticas producen rasgos específicos, pero ese enfoque no está disponible con ADN antiguo de especies extintas, donde solo existe un número reducido de genomas completos.

Para construir GenoMorph, dijo el CEO y cofundador de Colossal, Ben Lamm, la empresa combinó datos de desarrollo recolectados de pollos, codornices, patos y palomas con información genética y medidas de cráneo en 3D de más de 70 especies de aves, un proyecto que tomó más de un año. La IA aprende qué regiones del ADN están activas mientras distintas aves desarrollan su pico y su estructura facial, y usa esa información para predecir qué interruptores genéticos pudieron haber producido la apariencia distintiva del dodo, reduciendo un conjunto enorme de posibilidades a solo las diferencias que realmente importan. “Hasta ahora hemos identificado aproximadamente 2,300 objetivos de edición de ADN prometedores para la morfología craneofacial del dodo que ahora podemos probar en el laboratorio”, dijo.

Probar esos objetivos requirió un avance adicional: un sistema, desarrollado por Colossal, que usa nanopartículas lipídicas para entregar herramientas de edición génica directamente en embriones de aves en desarrollo, lo que permite a los investigadores ver cómo un cambio genético afecta el desarrollo sin esperar un ciclo de reproducción completo hasta la madurez sexual. La empresa también dijo el miércoles que su colonia de palomas nicobar —el pariente vivo más cercano del dodo— ha crecido a 36 aves y ha generado las células precursoras que se convierten en óvulos y espermatozoides, un paso que Colossal considera central para su estrategia de producir aves portadoras de rasgos del dodo.

Lamm dijo que GenoMorph en sí no edita genes; solo ayuda al equipo a identificar qué cambios vale la pena investigar, algo que describió como una forma de hacer la ingeniería genética más precisa, controlada y comprobable. El debut de la plataforma llega junto con un voto de confianza del inversionista Peter Diamandis, fundador de XPRIZE, quien anunció el miércoles que lanzó una nueva firma de capital de riesgo, NeoGenesis Capital, para respaldar a empresas que usan la plataforma de biología programable de Colossal en salud, agricultura y conservación.

Por qué importa

GenoMorph es una apuesta a que la IA puede hacer viable económicamente la desextinción incluso para especies con casi ningún ADN sobreviviente, una capacidad que, según sugirió Lamm, ya está comenzando a trasladarse a otros proyectos dentro del trabajo más amplio de biología de Colossal.